Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
IL3RAP26951 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IL3RAP26951 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms