Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGB2P26583 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms