Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA4P25789 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA4P25789 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms