Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRR1P24046 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms