Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMY2BP19961 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms