Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF3P18847 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF3P18847 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATF3P18847 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATF3P18847 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATF3P18847 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ATF3P18847 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATF3P18847 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATF3P18847 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF3P18847 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF3P18847 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF3P18847 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF3P18847 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms