Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR1P18146 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR1P18146 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms