Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC4P09017 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms