Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLK3P07288 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLK3P07288 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLK3P07288 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLK3P07288 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLK3P07288 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLK3P07288 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLK3P07288 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
KLK3P07288 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLK3P07288 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLK3P07288 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLK3P07288 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms