Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK1P06493 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK1P06493 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK1P06493 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK1P06493 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms