Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC1P02654 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC1P02654 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC1P02654 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms