Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTA1P02549 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms