Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms