Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CLDN9O95484 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CLDN9O95484 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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