Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSH5O43196 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSH5O43196 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSH5O43196 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSH5O43196 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSH5O43196 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSH5O43196 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSH5O43196 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSH5O43196 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MSH5O43196 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MSH5O43196 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MSH5O43196 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSH5O43196 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSH5O43196 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSH5O43196 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms