Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEFVO15553 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEFVO15553 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEFVO15553 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MEFVO15553 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms