Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms