Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLRMTO00411 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLRMTO00411 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms