Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
STRCP1A6NGW2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRCP1A6NGW2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms