Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RCE1Q9Y256 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms