Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRQQ9UMZ3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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