Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms