Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB23Q9ULC3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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RAB23Q9ULC3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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