Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms