Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC9Q9UKV0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms