Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP21Q9UK80 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms