Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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