Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms