Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms