Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SH3BP4Q9P0V3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SH3BP4Q9P0V3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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