Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSKIPQ9P0R6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms