Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCMF1Q9P0J7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms