Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP5Q9NZZ3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms