Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP1Q9NZU7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP1Q9NZU7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms