Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSD3Q9NYI0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms