Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms