Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL28Q9NXS3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms