Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHCHD3Q9NX63 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms