Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN6Q9NWW5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms