Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LHX9Q9NQ69 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms