Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NRIP3Q9NQ35 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms