Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR6Q9HBX8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms