Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLSPNQ9HAW4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms