Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR1EQ9GZS1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms