Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LNPKQ9C0E8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LNPKQ9C0E8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms