Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP1Q9C000 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms