Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSD3Q9BZ95 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSD3Q9BZ95 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms