Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDAC8Q9BY41 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC8Q9BY41 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms