Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms