Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms